國貿a市區有一所私立中學，這所學校是全國屈指可數天才、優秀學生所在之地。有那麼一個傳聞，這所學校裏有一個名為“ace”的特殊班級，據説是全校最頂尖學生的所呆之地，被稱為——王牌教室。然而自從有一天在一位神秘轉校生到來後，那個神秘班級的十二位特殊生也逐漸浮出水面。吊兒郎當的班主任，有暴力傾向的班長，學渣學習委員，沒有運動神經的體育委員等等讓人大跌眼鏡的角色……不過沒有人知道原來這個被學校和國家一起向外撒謊的特殊教室，那傳聞的十二人竟然是世界最強的特殊部隊成員，是被各國挑選出來的魔法特等生。一個個危險居高的任務，各種不平常的遭遇，這個教室裏學生和班主任的特殊校園生活就此展開。